Проникновение ВИЧ в клетки человека сопровождается взаимодействием белка вируса gp120 с рецептором CD4 и одним из клеточных корецепторов: CCR5 или CXCR4. Соответственно различают вирусы трех типов: обладающих тропностью к рецептору CCR5 – R5-тропные вирусы, обладающих тропностью к рецептору CXCR4 – X4-тропные вирусы, и вирусы, обладающие двойной тропностью. В последние годы определенные надежды в увеличении эффективности лечения ВИЧинфекции возлагают на новые классы препаратов, к которым относят антагонисты корецептора CCR5. Однако активность данных препаратов ограничивается R5тропными вирусами; препараты этой группы неэффективны против X4-тропных, а также R5X4-тропных вирусов. Поэтому перед назначением препаратов из класса ССR5-антагонистов (основной представитель класса — маравирок) необходимо определить тропизм ВИЧ у пациента. Для определения тропизма ВИЧ используют фенотипические и генотипические методы.
Фенотипические методы. Рекомбинантный псевдовирус, созданный с помощью искусственного лабораторного вируса и фрагмента генома исследуемого вируса пациента (регион env),используют для инфицирования клеточных линий, экспрессирующих на своей поверхности либо CCR5, либо CXCR4 корецептор.
Генотипические методы, основанные на секвенировании РНК или ДНК ВИЧ, приобретают в мире все большую популярность. Показано, что тропизм ВИЧ во многом определяется аминокислотной последовательностью гипервариабельной петли V3, расположенной в регионе поверхностного белка, кодируемого геном env.
Полученную в результате секвенирования нуклеотидную последовательность петли V3 анализируют при помощи специальных алгоритмов и оценивают вероятность той или иной тропности вируса. Для проведения оценки тропности ВИЧ на основании нуклеотидной последовательности обычно используют открытые онлайн ресурсы, например, базу данных «geno-2-pheno» ( http://coreceptor.bioinf.mpi-inf.mpg.de/).
Результатом анализа определения тропизма ВИЧ является установление тропности: CCR5 или CXCR4. В случае если вирус является R5-тропным, возможно назначение препарата класса CCR5-антагонистов. Если же вирус является X4тропным или имеет двойную тропность (R5X4) использование препаратов класса CCR5-анатагонистов запрещено вследствие их неэффективности.
Показания к исследованию тропизма ВИЧ
- Исследование назначают после принятия решения о смене АРВ терапии (после доказанной неэффективности существующей схемы, в том числе методом определения мутаций устойчивости ВИЧ) и переходе на класс ингибиторов CCR5. Вследствие высокой изменчивости ВИЧ такой тест необходимо провести непосредственно перед назначением CCR5-антагониста;
- тест также может быть рекомендован в случае вирусологической неэффективности применяемого маравирока (или какого-либо иного CCR5-антагониста).